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2019年6月13日發(fā)表在《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》上的一項(xiàng)最新研究，向我們展示了一種名為“宏基因組下一代測(cè)序”(mNGS)的開(kāi)創(chuàng)性檢測(cè)技術(shù)。該技術(shù)由加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)的科學(xué)家們所研發(fā)，用于診斷“不明病因的炎癥性神經(jīng)疾病”。相比其他臨床檢驗(yàn)方法，mNGS測(cè)試可以更好地識(shí)別多種感染。

加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)的實(shí)驗(yàn)室醫(yī)學(xué)教授、UCSF-Abbot病毒診斷和探索中心的主任 Charles Chiu博士說(shuō)：“全美醫(yī)院有一半的腦膜炎和腦炎病例，還沒(méi)找出感染的原因。而這些危重患者急需更好的檢測(cè)工具。”

與傳統(tǒng)由醫(yī)生直覺(jué)驅(qū)動(dòng)的常規(guī)檢驗(yàn)不同，mNGS測(cè)試提供了一種無(wú)偏倚的方法，可以檢測(cè)出患者脊髓液中存在的幾乎所有可能的病原體--細(xì)菌、病毒、真菌和寄生蟲(chóng)，為醫(yī)生提供明確的治療方向。

這項(xiàng)研究只招募最具挑戰(zhàn)性的病例。入選者必須是因急性神經(jīng)系統(tǒng)疾病住院，但沒(méi)有獲得明確診斷的病人。這項(xiàng)研究包括了204名兒童和成人患者，其中大多數(shù)來(lái)自加州，他們患有腦膜炎(大腦周圍組織的炎癥)、腦炎(大腦本身的炎癥)或脊髓炎(脊髓的炎癥)。

研究過(guò)程中，通過(guò)傳統(tǒng)檢驗(yàn)方法查出的諸多感染，mNGS測(cè)試都能測(cè)出。但傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法通常是一次檢測(cè)一種病原體，并要求醫(yī)生知道他們?cè)趯ふ沂裁床拍艹晒Α４送?，mNGS測(cè)試還發(fā)現(xiàn)了13種傳統(tǒng)檢測(cè)沒(méi)有發(fā)現(xiàn)的感染，比如一例由圣路易斯腦炎病毒感染的病例，自1986年以來(lái)，這種病毒在加州從未出現(xiàn)過(guò)。在半數(shù)以上的病例中，mNGS診斷對(duì)于指導(dǎo)這些患者的治療是不可或缺的。在一個(gè)被傳統(tǒng)檢測(cè)遺漏的戊型肝炎病毒感染病例中，成功的mNGS診斷可能使患者免于進(jìn)行肝移植。

Charles Chiu博士說(shuō)：“mNGS測(cè)試通常是作為最后的檢測(cè)手段，所以我們招募最難診斷的病人。對(duì)于這些患者，結(jié)合所有傳統(tǒng)的微生物學(xué)測(cè)試方法，能做出明確診斷的不到50%。但mNGS這種單一測(cè)試就顯現(xiàn)出了重大影響。”

在31名患者中，mNGS測(cè)試確定了32種神經(jīng)系統(tǒng)感染。包括19例此前通過(guò)常規(guī)檢測(cè)診斷出來(lái)的感染，以及13例僅靠mNGS診斷出的感染。

加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)神經(jīng)學(xué)副教授Michael Wilson博士指出，傳染性腦炎和非傳染性腦炎患者在臨床上是無(wú)法區(qū)分的，mNGS測(cè)試有助于診斷那些介于感染和非感染之間的病例。

事實(shí)上，不到一半的腦膜炎和腦炎病例是由感染引起的。其余的大部分是自身免疫反應(yīng)的結(jié)果，即病人自身的免疫系統(tǒng)攻擊神經(jīng)系統(tǒng)。這兩種情況需要不同的治療。如果病人是感染性疾病，抑制他的免疫系統(tǒng)反而會(huì)造成傷害。同理，如果病人是自身免疫性疾病，使用抗生素不僅無(wú)效，而且還會(huì)無(wú)端地增加抗生素耐藥性。所以，治療這類病人，醫(yī)生首先要明確他們屬于哪一類疾病。

不過(guò)，這項(xiàng)新測(cè)試也并非完美。有26種感染無(wú)法通過(guò)mNGS測(cè)試被診斷出來(lái)。因?yàn)檫@些病原體的DNA不存在于脊髓液中，需要對(duì)不同的樣本類型(如腦膿腫組織)進(jìn)行分析，或使用間接檢測(cè)方法(如抗體檢測(cè))才能作出診斷。這項(xiàng)研究中的一個(gè)例子是西尼羅病毒感染，通過(guò)測(cè)序脊髓液中的病毒遺傳物質(zhì)是無(wú)法將它識(shí)別的，因?yàn)樗鼇?lái)得快去得也快。

而在一些病例中，mNGS發(fā)現(xiàn)了結(jié)核等感染的跡象，它們?cè)诩顾枰褐辛粝路浅］p微的痕跡。雖然沒(méi)有檢測(cè)到足夠高的感染水平來(lái)明確診斷，但知道它們的存在，即使是微量的，仍然有助于指導(dǎo)醫(yī)生采取另一種診斷方法來(lái)確認(rèn)病原體是否存在。